Rumah Sakit ini merupakan konversi/pengembangan dari Klinik dan Rumah Bersalin yang beroperasional sejak tanggal 9 September 1997 di dusun Bintaran, Jambidan, Banguntapan, Bantul. Dari Klinik inilah berkembang menjadi sebuah Rumah Sakit Umum dengan tipe kelas D pada tanggal 20 Februari 2008 dan secara resmi ijin penyelenggaraan Rumah Sakit Umum Rajawali Citra didapatkan.
Ini merupakan awal baru perjuangan Yayasan Rajawali Citra yang mempunyai tanggung jawab lebih besar dari sebelumnya dalam ikut serta meningkatkan derajat kesehatan masyarakat Kabupaten Bantul pada khususnya dan bangsa Indonesia pada umumnya.
